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理學院由原數學系和物理與教育技術系于2008年合并組建而成，現有數學與應用數學、物理學、教育技術學、科學教育、信息與計算科學共五個本科專業，致力于面向地方基礎教育和經濟社會文化發展培養應用型創新人才。現有數學與應用數學、物理學、教育技術學三個專業招生，在校學生數為997人。

理學院師資力量雄厚，擁有一支愛生敬業、治學嚴謹、團結協作、結構合理的師資隊伍。現有教職員工52人，其中教授7人，副教授16人，高級實驗師1人，講師28人。各學歷層次中有博士7人（2人在讀），碩士25人。擁有省級教學名師1名，云南省突出貢獻人才獎獲得者1名、玉溪市中青年學科帶頭人5名。數學與應用數學教學團隊為省級教學團隊，理論物理團隊為云南省教育廳高校科研創新團隊。

學院堅持“以學生能力形成核心，促進學生知識、能力、素質協調發展”的辦學理念，高度重視學生創新實踐能力的培養，構建了完備的實踐教學體系，擁有優良的實驗實習條件。現有物理實驗教學中心、教育技術實驗中心和數學與應用數學實驗中心三個實驗中心，下設22個實驗室，其中物理實驗中心為校級實驗教學示范中心。實驗室總面積3000多平方米，教學儀器設備值達600萬元，完全滿足本院各專業實驗教學和全校理工類專業基礎物理實驗的需要，實驗開出率達100%，不斷增加綜合性、設計性、創新性實驗。建設有10余個校外實習實踐基地。學院著力推進教學建設與改革，大力提高人才培養質量，先后獲得省、校級本科教學工程項目40余項、省校級教學獎勵30余項。近年來學生參加全國大學生數學建模競賽60多人次分獲國家級和省級獎勵，“挑戰杯”大學課外學術活動等比賽，獲國家級獎5項，省部級獎50余項；學生省、校級創新創業訓練項目60余項；考研人數及錄取率逐年上升，近五年畢業生考取香港中文大學、四川大學、西南大學、云南大學、寧波大學、浙江師范大學、南京師范大學、西北師范大學、廣西大學等院校的研究生累計達70多人。畢業生的能力素質深受社會好評，近五年的平均就業率達96%以上。

在做好人才培養工作的同時，理學院高度重視科研和學科建設工作，形成了教學與科研相互促進的良性發展模式。擁有物理學、數學兩個校級重點學科，在天體物理、統計物理與復雜系統、光譜分析、代數、微分方程等學科方向上具有一定的研究實力，形成了結構合理的科研團隊。近五年來，由本院老師主持的項目有：國家自然科學基金資助1項、國家青年自然科學基金項目1項、國家教育部重點項目1項、云南省應用基礎研究計劃面上項目8項，云南省教育廳科學研究基金項目6項、高校橫向聯合項目1項，各項資助和學校的配套資助經費近260萬元。在國內外相關學術刊物上累計發表論文200多篇，其中70多篇被SCI、EI、ISTP、MR、ZBL索引。獲得省級科研獎勵3項、地廳級科研獎勵10余項。

“十二五”期間，我院將以加強本科專業建設、提高人才培養質量核心，著力推進人才培養模式改革，強化師資隊伍建設，不斷提升學科水平和科研實力，積極為地方經濟社會文化發展作出貢獻，為實現學校“申請碩士點、創建區域性高水平大學”的目標而努。