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工程技術學院是學校最早開設理工科專業的院(系)，前身為江蘇省食品公司職工中等專業學校，1987年該校整體并入江蘇商業管理干部學院成為學院中專部，即為江蘇省商業學校。1994年后設立工程技術系;2007年工程技術系擴建為工程技術學院。學院不斷創新，加大專業建設與課程改革力度。現已形成食品、制冷與空調、汽車3大專業群。學院現為“江蘇省食品工業協會”、“江蘇省制冷協會”、“江蘇省分析測試學會”、“江蘇調味副食品協會”“江蘇省蔬菜協會”“江蘇省汽車交易管理協會”、“南京城市汽車聯盟”的會長或常務理事單位。

工程技術學院師資力量雄厚，現有教職員工42人，具有高級以上職稱20人，其中教授7名，副教授13名;擁有碩士學位及以上的教師達90%以上，其中博士7名;“青藍工程”中青年學術帶頭人2名，優秀青年骨干教師培養對象1名;“333人才培養工程”第三層次培養對象2名;“雙師”教師比例為90%以上，有企業經歷的教師占50%;出國進修教師比例為30%。此外，學院聘請行業兼職教師近30名。

工程技術學院與江蘇出入境檢驗檢疫局、南京市產品質量監督檢驗院、大明路國際汽車街、三菱重工空調系統(上海)有限公司等30多家建立校外實習實訓基地。學院不斷加強與國際、國內知名企業的合作，建有“食品安全與營養”國家級實訓基地、江蘇省食品安全工程技術研究開發中心、成立了“三菱重工中央空調培訓中心”、共建了“模擬環境研發中心”等校內生產性實訓基地。依托“江蘇經貿職業技術學院國家職業技能鑒定所”，進行公共營養師、汽車營銷師、制冷設備維修工及食品檢驗工等職業工種等級培訓和鑒定。

工程技術學院注重、鼓勵和培養教師進行科研工作，近三年來，完成縱橫向課題70余項，在SCI、EI和國內核心期刊發表論文40余篇，申請并授權專利20余項。

工程技術學院始終堅持以就業為導向，以服務為宗旨，走產教融合的辦學道路。注重能力培養，通過頂崗實習等工學結合新模式，使每個學生“創新、創業、創優”能力都有充分的發展。服務地方企業，發揮專業優勢，積極為地方企業服務。先后南京農副產品物流配送中心、日本三菱重工業上海有限公司、南京紅太陽集團等多家企業合作，完成檢測、開發、培訓等工作。

為了不斷提高學生實踐能力和創新能力，為經濟建設和社會發展培養更多技術、技能型人才，工程技術學院先后參與國家或省級專業技能大賽和“挑戰杯”創新創效創業大賽，多次獲得國家、省市級一、二、三等獎。工程技術院是一個團結、和諧、奮進的團隊，先后多次獲得江蘇省級機關先進職工小家、江蘇省級機關巾幗文明示范崗，2013年度被江蘇省總工會授予“江蘇省五一巾幗標兵崗”。

工程技術學院積極做好學生就業、創業工作，鼓勵學生自主創業，為學生樹立典型，榜樣。工程技術學院畢業生受到用人單位的廣泛認可，取得較好的社會影響。學院將振奮精神、團結合作，與時俱進，不斷為社會輸送優秀的人才。