食品工程系是學校較早設立的系部之一，經過十幾年的發展，現有食品科學與工程、食品質量與安全兩個本科專業和食品營養與檢測專科專業，其中食品科學與工程專業獲批為湖北省戰略性新型(支柱)產業人才培養計劃項目，同時也是學校第二學士學位授權專業。
食品工程系擁有一支結構合理的高水平教師隊伍。由全國優秀教師、湖北省教學名師黃澤元教授擔任學科帶頭人，以四川大學、江南大學、華中農業大學等重點高校畢業的博士、碩士組成教學團隊;從大學、科研院校和知名企業聘請了6名客座教授。近五年，教師承擔了省、市級及校級的多項科研課題和教研課題，在國內外核心期刊發表學術論文五十多篇，出版教材十多部。
食品工程系本著立德尚品、修業卓型的育人理念，著力于應用型、創新型人才的培養。擁有伊利乳業(黃岡)有限公司、武漢仟吉食品有限公司、仙桃精武食品工業園有限公司(省級優秀院士專家工作站)等省內外50余個穩定的畢業生實習實訓和就業基地。與中國檢驗認證集團、中國質量認證中心、湖北省勞動和社會保障廳、湖北省食品工業協會等政府機構部門和行業組織建立了密切的合作關系，讓學生在畢業之前熟練地掌握職業技能，取得國家認可的職業資格證書。畢業生就業率一直保持在95%以上，畢業生在出入境檢驗檢疫、食品藥品監督局、質檢局等事業單位，中糧集團、伊利乳業等大中型食品加工企業，以及農產品深加工企業從事與專業相關的教學、科研、品控檢驗等工作。每年有15%左右的優秀畢業生考取國內外重點大學碩士研究生;同時涌現出了一批自辦公司、成功創業的優秀校友典型。
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