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動物科學系一直是上海農學院和上海交通大學農業與生物學院主要系部之一。上海農學院創辦于1959年, 1999年9月上海農學院并入上海交通大學，成立了上海交通大學農學院，2003年3月農學院更名為農業與生物學院。

師資隊伍

學科現有教師20人，其中教授7人，研究員3人,副教授3人，副研究員4人，高級實驗師1人，講師2人。所有教師全部具有博士學位，大部分都在國外進修和學習過。

人才培養

學士點：動物科學專業(農學學士,4年)

碩士點：畜牧學(一級學科，學術碩士，2.5年)、預防獸醫學(二級學科，專業碩士，2.5年)

博士點：生物醫學工程(生物技術、預防獸醫學，4-5年)、動物科學與工程(交叉學科博士點，4-5年，2017年招生)

科學研究

動物科學系主要研究方向：動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料、動物衛生與防疫。

近5年來，動物科學系先后承擔了國家與省部級重點科研課題52項，開展了動物基因組學與分子育種、統計基因組學與生物信息學、繁殖生物技術、營養與免疫、營養與自由基生物學、抗體工程、病原檢測技術、傳染病防治等領域的研究工作，并在統計基因組學、實驗小型豬模型、人獸共患病防治等方面形成了特色。

成果和獎勵

近5年來，主持/參加國家和上海市科研項目多項，其中：2011-2015主持國家“863”項目1項;2011-2015參與國家科技支撐項目1項;2011-2015主持/參與國家重大科技專項4項;2011-2015主持國家自然科學基金項目22項;主持上海市科技興農重點攻關項目24項。取得多項科研成果，其中：國際學術期刊發表SCI/EI論文162篇;授權發明專利45項;申請發明專利77項;授權軟件著作權5項;開放2個基礎數據庫。

國際合作交流

動物科學系先后與康奈爾大學、加利福尼亞大學河濱分校、弗吉尼亞理工大學、希伯來大學、墨爾本大學等國際知名大學開展了合作辦學和學術交流。