南京農業(yè)大學動物醫(yī)學院前身為東南大學畜牧獸醫(yī)系，創(chuàng)立于1921年，是我國最早的畜牧獸醫(yī)系之一。1952年全國院系調整時組建南京農學院畜牧獸醫(yī)系，分設畜牧、獸醫(yī)兩個專業(yè)。1984年，南京農業(yè)大學動物醫(yī)學院成立，分設畜牧系和獸醫(yī)系。1994年，撤系建院成立動物醫(yī)學院。動物醫(yī)學院1984年首獲博士學位授予權，1992年設立獸醫(yī)學博士后流動站，1998年獲獸醫(yī)學一級學科博士學位和碩士學位授予權，2007年獸醫(yī)學一級學科被評為國家重點學科。動物醫(yī)學院現(xiàn)為國務院學位委員會獸醫(yī)學科評議組第一召集人任職單位、全國獸醫(yī)專業(yè)學位教育指導委員會秘書處掛靠單位和主任委員任職單位。現(xiàn)有2個部級開放實驗室和1個部級工程中心，11個部批和校級研究室或中心。2005年，動物醫(yī)學專業(yè)被評為江蘇省品牌專業(yè)，2008年評為教育部特色專業(yè)。“動物健康與獸醫(yī)公共衛(wèi)生”為三期“211工程”建設項目。
動物醫(yī)學院師資力量雄厚，學科均衡，擁有一支銳意進取、年齡結構合理的學術隊伍。現(xiàn)有教職工100名，其中教授29名，副教授、副研究員、高級獸醫(yī)師、高級實驗師30名，講師、實驗師27名。具有博士學位者62名，碩士學位者8名，其中博士生指導教師26名，碩士生指導教師50名。動物醫(yī)學院現(xiàn)有動物醫(yī)學和動物藥學2個本科專業(yè)及動物健康與生產強化班，動物醫(yī)學專業(yè)連續(xù)多年位居國內大學同類專業(yè)前列。
學院下設三個系，即基礎獸醫(yī)學系、預防獸醫(yī)學系和臨床獸醫(yī)學系。基礎獸醫(yī)學系有農業(yè)部動物生理生化實驗室，下設動物解剖學、動物組織胚胎學、動物生理學、動物生物化學、獸醫(yī)藥理學和獸醫(yī)病理學學科組；預防獸醫(yī)學系有農業(yè)部獸醫(yī)細菌學實驗室和農業(yè)部動物疫病防治技術創(chuàng)新中心，下設獸醫(yī)微生物學、家畜傳染病學和家畜寄生蟲學學科組；臨床獸醫(yī)學系設有獸醫(yī)內科學、獸醫(yī)外產科學、中獸醫(yī)學學科組。學院附設畜牧與獸醫(yī)編輯部、動物醫(yī)院、實驗動物中心、動物藥廠和40個校外教學實習基地。
“十一五”期間，學院承擔了多項“973”、“863”、公益性行業(yè)專項、轉基因重大專項、國家支撐計劃等國家級重大項目和多項部、省科研項目及國際合作項目。每年平均在核心期刊上發(fā)表高質量的科研論文200多篇，其中SCI收錄近60篇。在重大人獸共患病、重大動物疾病、動物寄生蟲病、營養(yǎng)生理生化及調控、分子神經內分泌、功能基因表達及調控、細胞生物學、免疫病理、新獸藥創(chuàng)制、畜禽營養(yǎng)代謝及中毒病、畜禽骨骼與關節(jié)疾病、動物生殖調控及中西獸醫(yī)結合等方面的研究達到了國內領先或國際先進水平，取得了顯著成果，其中，“豬鏈球菌病研究及防控技術”獲2007年度國家科技進步2等獎，為國家經濟建設和社會發(fā)展作出了重大貢獻。
90余年來，學院為國家培養(yǎng)了5000多名本科生和研究生，其中有許多人已成為國內外著名的教育家、科學家和實業(yè)家等，為我國的畜牧獸醫(yī)事業(yè)做出重要貢獻。目前動物醫(yī)學院在校學生共有1700多人。其中本科生887人，碩士生464人，博士生114人（外國留學研究生16人），獸醫(yī)專業(yè)學位博士生和碩士生304人，博士后研究人員5人。為了獎勵德、智、體全面發(fā)展的優(yōu)秀本科生、研究生，學院設立了“羅清生獎學金”、“六和獎學金”、“輝瑞普強獎學金”、“恒豐強獎學金”、“仕必得獎學金”、“國龍獎學金”、“勃林格殷格翰獎學金”、“南農高科獎學金”、“春苗獎學金”、“上海農場獎學金”、“臺灣信元”等十多項獎學金，最高獎金每人達10000元。
學院先后與德國、美國、日本、加拿大、丹麥、澳大利亞、英國、西班牙等國的有關學校、研究機構建立了合作關系，國際學術交流十分活躍。近5年，學院教師先后有110人次到國外進修，攻讀學位或合作科研。他們回國后，在教學科研上發(fā)揮著重要作用。此外，學院先后舉辦近20期國際獸醫(yī)針灸班，為日本、德國等國家培訓了200多名學員。
在新的形勢下，南京農業(yè)大學動物醫(yī)學院以培養(yǎng)高素質創(chuàng)新性人才為根本，以滿足國家重大需求和服務社會需要為己任，團結、求實、拼搏、奮進，力爭為國家和社會做出更大的貢獻。
動物醫(yī)學
A培養(yǎng)目標：培養(yǎng)從事與動物健康和衛(wèi)生相關工作，德、智、體、美全面發(fā)展，具有創(chuàng)新精神和實踐能力的應用型、復合型人才，為促進畜牧業(yè)發(fā)展和保護人類健康服務。相關的領域包括：畜禽、伴侶動物疾病和人與動物共患疾病的診斷與防治，環(huán)境與動物保護，動物檢疫，動物產品安全，動物產品進出口貿易，動物藥物和生物制品生產等。
B培養(yǎng)對象：本科，學制五年，授予農學學士學位
C主要課程：動物解剖學、動物組織胚胎學、動物生物化學、動物生理學、獸醫(yī)藥理學、動物病理學、獸醫(yī)微生物學、獸醫(yī)免疫學、動物性食品衛(wèi)生學、獸醫(yī)臨床診斷學、獸醫(yī)寄生蟲病學、家畜傳染病學、家畜內科學、家畜手術學、家畜外科學、獸醫(yī)產科學、中獸醫(yī)學等。
D就業(yè)情況：就業(yè)率100%，其中升學率約40%。去向主要是科研院所、高等院校、企事業(yè)單位和一些政府部門，從事教學、科研、防疫、檢疫和獸醫(yī)臨床診療等工作。
動物藥學
A培養(yǎng)目標：培養(yǎng)從事與動物藥品和動物生物制品研究與開發(fā)相關工作，德、智、體、美全面發(fā)展，具有創(chuàng)新精神和實踐能力的應用型、復合型人才，為提高我國動物藥品和動物生物制品的質量和競爭能力服務。
B培養(yǎng)對象：本科，學制五年，授予農學學士學位
C主要課程：實驗動物學、動物形態(tài)學、動物生物化學、動物生理學、動物藥理學、動物毒理學、動物病原學、分子生物學、藥物制劑學、物理化學、藥物化學、藥物分析、中藥制劑學、動物免疫學、獸醫(yī)生物制品學、獸醫(yī)法規(guī)等。
金善寶實驗班（動物生產方向）
A培養(yǎng)目標：培養(yǎng)德、智、體、美全面發(fā)展，具備動物醫(yī)學、動物藥學、動物科學等方面的基本理論、基本知識和基本機能，能夠在與動物健康和衛(wèi)生、牧產業(yè)及相關部門或單位從事教學、科研、開發(fā)與技術推廣等工作的創(chuàng)新型、復合型人才，為促進畜牧業(yè)發(fā)展和保護人類健康服務。
B培養(yǎng)對象：本科，動物健康方向學制5年，動物生產方向學制4年，授予農學學士學位
C專業(yè)分流：實驗班實行中期考核與分流制度。在第五學期初實行分流，分流方向為動物健康方向（動物醫(yī)學院）和動物生產方向（動物科技學院）；未達到學校要求的學生，取消強化班學習資格，轉入動物醫(yī)學、動物科學類相關專業(yè)學習。
D主要課程：動物學、動物解剖學、動物組織胚胎學、動物生物化學、動物生理學、獸醫(yī)藥理學、動物病理學、獸醫(yī)微生物學、獸醫(yī)免疫學、動物性食品衛(wèi)生學、獸醫(yī)臨床診斷學、獸醫(yī)寄生蟲病學、家畜傳染病學、家畜內科學、家畜手術學、家畜外科學、獸醫(yī)產科學、中獸醫(yī)學、生物統(tǒng)計與試驗設計、動物遺傳學、動物營養(yǎng)學、動物繁殖學、家畜育種學、飼料學、家畜環(huán)境衛(wèi)生學、牛羊生產學、豬生產學、禽生產學等。
E深造方向：基礎獸醫(yī)學、預防獸醫(yī)學、臨床獸醫(yī)學、動物遺傳育種與繁殖、動物營養(yǎng)與飼料科學等。
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