含海洋科學專業（海洋生物資源、環境海洋學和海洋管理3個專業方向）、環境工程專業，入學第二年確定專業及專業方向。
特色優勢：本科、碩士、博士培養體系完備，與國外多所大學有交流培養項目；上海市教育高地、上海市“085”工程建設專業；海洋環境工程為上海市重點學科。
【海洋科學（環境海洋學方向）】本科，學制四年，授予理學學士學位
培養目標：培養具有堅實的數學、物理、化學及海洋環境科學方面的基本理論和知識，受到海洋科學研究方面的相關訓練，掌握海洋科學基本調查方法和實驗技能，具有從事海洋調查和海洋科學研究的基本能力，能在海洋科學及相關領域從事科研、教學、管理及技術工作的高級專門人才。
專業特色：本校具有完備的培養體系和學科平臺，從本科、碩士、博士到博士后，支撐了學生的可持續發展，有漁業資源碩士點，海洋科學碩士點，漁業資源博士點和博士后流動站。
學生在校期間可參加我校與美國緬因州立大學、日本東京海洋大學、日本北海道大學、日本三重大學以及我國臺灣海洋大學合作的留學項目，參加與美國密歇根州立大學、英國班戈大學合作的暑期游學項目，此外，學生還可參加我校與英國班戈大學3.5年+1.5年的本科+碩士研究生項目。
主要課程：流體力學、計算流體力學、海洋科學導論、物理海洋學、工程環境海洋學、海洋調查方法、海洋要素計算及預報、海洋數值模型、區域海洋學、衛星海洋學、海洋氣象學、海洋生態學、環境評價與規劃等。
就業方向：本專業畢業生主要到地方海洋局、交通部、海洋環保、漁業生產部門等有關部門等從事科研、管理等工作，也可到相關高等院校、科研機構、海洋局所屬業務單位等從事教學和科研管理工作。
往屆學生考取國內研究生的學校有中國科學院南海海洋研究所等，還有學生考取了美國紐約州立大學、日本北海道大學、美國路易斯安那州立大學等國外高校研究生。
【海洋科學（海洋生物資源方向）】本科，學制四年，授予理學學士學位
培養目標：培養具有堅實的數學、物理、生物及海洋生物資源科學方面的基本理論和知識，受到海洋科學研究方面的相關訓練，掌握海洋科學基本調查方法和實驗技能，具有從事海洋調查和海洋科學研究的基本能力，能在海洋科學及相關領域從事科研、教學、管理及技術工作的高級專門人才。
專業特色：綜合了社會需求和本專業在大洋生物資源開發利用方面的優勢而開設。本專業強調實踐技能訓練，在海洋生物資源（尤其是大洋漁業資源）的開發利用、資源評估與管理、以及資源保護生物學方面具有很強的實力與特色。
本校具有完備的培養體系和學科平臺，從本科、碩士、博士到博士后，支撐了學生的可持續發展，具有漁業資源碩士點，海洋科學碩士點，漁業資源博士點和博士后流動站。
學生在校期間可參加我校與美國緬因州立大學、日本東京海洋大學、日本北海道大學、日本三重大學以及我國臺灣海洋大學合作的留學項目，參加與美國密歇根州立大學、英國班戈大學合作的暑期游學項目，此外，學生還可參加我校與英國班戈大學3.5年+1.5年的本科+碩士研究生項目。
主要課程：海洋科學導論、物理海洋學、海洋調查方法、海洋生物學、海洋生態學、海洋浮游生物學、微生物學、海洋動物生理學、魚類學、底棲生物學、生物技術、漁業資源學、漁業資源評估與管理等。
就業方向：可從事海洋生物資源調查和開發利用、海洋環境保護和監測、資源增養殖、海洋生物技術及海洋資源的研究、教學、技術開發和管理等方面工作。近三年代表性就業單位如上海康承生物科技有限公司、杭州極地海洋世界科普有限公司等。往屆學生考取國內研究生的學校有：浙江大學等。還有同學考取了日本東京海洋大學、美國緬因大學、法國蒙彼利埃大學等國外高校碩士研究生。
【海洋科學（海洋管理方向）】本科，學制四年，授予理學學士學位。
培養目標：培養具有良好科學素養、實踐能力和創新精神，具備相關自然科學、人文社科基礎理論，系統掌握海洋科學、海洋管理的基本理論和海洋政策、海洋法規基本知識，能在政府海洋管理部門、有關科研院校及其他相關單位從事海洋開發、管理及有關科研、教學的專業人才。
專業特色：是為滿足國家和社會對海洋管理人才的需求而發展的新興專業。屬綜合交叉學科專業方向。我校海洋管理專業方向的定位是以學習海洋自然科學與技術為基礎，交叉學習管理學、法學、經濟學等課程，掌握海洋開發利用、保護與管理的政策、法規和管理制度，核心內容是海洋資源和環境的管理，特色和優勢是海洋生物資源管理和海洋環境管理。在我校實施的“上海地方本科院校‘十二五’內涵建設”項目中，海洋管理專業方向被列為重點建設專業方向。
我校對應的碩士、博士招生點：海洋科學一級學科碩士、博士點、漁業資源、漁業環境保護與治理二級學科碩士點、博士點。
學生在校期間可參加我校與美國緬因州立大學、日本東京海洋大學、日本北海道大學、日本三重大學以及我國臺灣海洋大學合作的留學項目，參加與美國密歇根州立大學、英國班戈大學合作的暑期游學項目，此外，學生還可參加我校與英國班戈大學3.5年+1.5年的本科+碩士研究生項目。
主要課程：海洋科學導論、海洋法、海洋資源學、海洋生物學、海洋生態學、海洋管理概論、海洋生物資源管理、海岸帶開發與管理、海域使用管理、環境法與環境管理。
就業去向：在政府部門從事海洋行政管理等工作；在有關海洋研究機構、教學機構等事業單位從事海洋管理研究和教學工作；在有關海洋的其他企事業單位和社會團體從事相關的管理、咨詢、服務等工作。近三年代表性就業單位：上海市海洋局、山東省長島市海洋與漁業局、上海帆奕海事設備有限公司、上海長風海洋世界有限公司。
【環境工程】本科，學制四年，授予工學學士學位
培養目標：致力于培養具有可持續發展理念，掌握環境科學與工程以及給排水等方面的基礎理論和專業知識，能從事水、氣、聲、固體廢物等污染防治、給排水工程設計、地表水與地下水污染修復、環境規劃和資源保護、環境評價與管理等方面的研究、開發與設計的專業技術人才。
專業特色：海洋環境工程為上海市重點學科；環境科學與工程一級學科碩士點。
注重環境工程專業的通識教育，以正統的污染防治、給排水工程設計、生態修復、環境規劃、評價與管理等方面知識技能培養為基礎；同時，結合我校發展規劃的三大重點方向之一——海洋科學的學科教育，著力打造具有海洋科學特色的環境工程專業，培養具有良好科學素養、實踐能力和創新精神，適應地方海洋環境保護事業的高水平工程技術人才。
學生在校期間可參加我校與日本北海道大學、日本三重大學以及我國臺灣海洋大學合作的留學項目，參加與美國密歇根州立大學、英國班戈大學合作的暑期游學項目，此外，學生還可參加我校與英國班戈大學3.5年+1.5年的本科+碩士研究生項目。
主要課程：基礎化學、生物化學、物理化學、工程力學、環境工程原理、環境化學、水力學與泵、環境監測、水污染控制工程、空氣污染控制工程、固體廢棄物處理與處置、物理性污染控制工程、環境評價與規劃、給排水處理等。
就業方向：學生畢業后可到設計院、環保工程公司、公用事業單位從事工程設計、運營、管理等環境保護工程技術工作，可到環保咨詢公司、環境科學研究院從事環境影響評價、環境規劃、清潔生產審核、上市企業環保核查、環境監理等環境技術咨詢工作，還可到科研院所、環保科技公司從事環保技術、材料、設備的研發和銷售等環保技術研發。此外，學生還可以報考海洋局、環保局、環境監察、環境監測等相關部門從事公務員或事業人員工作。近三年代表性就業單位有：各級環保局及環境監測站、自來水公司或污水處理廠、環保類公司企業等。
往屆畢業學有超過15%的考取外校環境科學與工程一級學科碩士研究生，包括北京大學、同濟大學、南開大學、華東師范大學、上海理工大學、東華大學、華東理工大學等高校。還有學生考取了美國東北大學、日本北海道大學等國外高校碩士研究生。
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