西昌學院動物科學學院是學校最早設立本科專業的學院，現設立有動物科學、動物醫學、水產養殖學、野生動物與自然保護區管理、生物科學、環境科學與工程等6個本科專業和1個畜牧獸醫專科。
動物醫學本科專業
（四川省特色專業、農學學士、農林類）
培養目標：本專業培養具備基礎獸醫學、臨床獸醫學、預防獸醫學等方面知識，具有畜禽疾病的診斷、預防，畜禽生產管理，畜禽飼料配方的開發等方面能力，能在獸醫部門、動物生產與管理、動物藥品開發及檢驗、動物產品衛生檢疫等部門從事獸醫保健與檢疫、教學與科研、技術開發與服務、經營與管理的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后，適合在畜牧獸醫業務部門、動物養殖與產品加工企業、寵物醫院、動物藥品生產與銷售企業及監測部門、動物檢疫、教學與科研等部門工作。
主要課程：動物解剖與組織胚胎學、動物生理學、動物生物化學、家畜病理學、獸醫藥理學、動物微生物及免疫學、獸醫臨床診斷學、畜牧生產學、獸醫內科學、獸醫外科學、獸醫產科學、小動物疾病學、動物傳染病學、動物寄生蟲病學、獸醫產科學、獸醫公共衛生學、中獸醫學、市場管理與營銷學等。
動物科學本科專業
（農學學士、農林類）
培養目標：本專業培養具備動物科學方面的基本理論、基本知識和基本技能，能在畜牧產業及其相關領域和部門從事畜禽生產的良種繁殖、飼養管理、飼料生產與質量檢測、科技推廣與開發、經營與管理、教學與科研方面的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后，適合在畜牧獸醫業務部門、動物養殖和良種繁育企業、飼料生產企業、動物食品加工企業、教學與科研等部門工作。
主要課程：動物解剖及組織胚胎學、動物生理學、動物生物化學、動物遺傳學、動物育種學、動物繁殖學、動物營養學、飼料學、飼草生產學、家畜環境衛生及牧場設計、飼料分析與質量檢驗、牛生產學、豬生產學、羊生產學、家禽生產學、特種經濟動物養殖學、動物產品加工學、動物醫學概論、市場管理與營銷學等。
水產養殖學本科專業
（文理兼收、農學學士、農林類）
培養目標：本專業培養具備水產動植物增養殖、飼料加工及質量檢測、疫病防治、繁育等方面的能力；能夠在水產養殖生產、教育、科研和管理等部門從事水產動植物養殖、疾病診療、動物飼料生產與質量檢驗、科學研究、教學、水產開發與管理等工作的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后，適合在漁政管理部門、動物檢疫部門、水產養殖企業、飼料和藥品生產企業及監測部門、水族館、教學與科研等單位工作。
主要課程：魚類學及組織胚胎學、動物微生物及免疫學、動物生理學、水生生物學、水環境化學、池塘養魚學、內陸水域增養殖學、甲殼類增養殖學、貝類增養殖學、動物遺傳學、水產動物育種學、水產動物營養與飼料學、名特水產動物養殖學、飼料分析與質量檢驗、水產動物疾病學、水生觀賞動物養殖學、海水魚類養殖學、市場管理與營銷學等。
野生動物與自然保護區管理本科專業
（文理兼收、農學學士、農林類）
培養目標：本專業培養具備野生動物繁育、馴養、檢疫、疾病防治和自然保護區規劃設計、管理以及生態旅游等方面的知識，具有野生動物飼養管理、保護利用、疾病防治、景區規劃設計、環境保護、旅游區規劃、旅游項目策劃等方面能力；能在野生動物科研院所、海關和邊境口岸、自然保護區、動物園、旅游行業等部門從事野生動物保護、利用、檢疫和自然保護區規劃與管理以及生態旅游等工作的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后，適合在野生動物和自然保護區管理部門、海關和邊境口岸、動物園、旅游行業、動植物檢檢疫驗、教學與科研等單位工作。
主要課程：動物生物學、鳥獸學、動物解剖及組織胚胎學、森林生態與環境、動物微生物及免疫學、動物生理學、動物遺傳育種學、野生動物保護生物學、動物繁殖學、旅游學概論、動物營養與飼料學、生態旅游開發、野生動物檢疫及病理學、觀賞動物養殖學、野生動物管理學、野生動物疾病防治學、遙感與地理信息系統(GIS)、自然保護區規劃與管理、森林資源經營管理等。
環境科學與工程本科專業
（工學學士、農林類）
培養目標：本專業培養具有扎實的高等數學、大學英語、計算機基礎、數據庫語言專業必需的基礎理論知識，具有環境科學概論、化工原理、儀器分析、環境化學、普通生物學、環境監測、環境生物學、環境影響評價、環境微生物學、工程制圖、環境經濟學、環境工程學等方面的專業理論知識，具有環境影響評價、環境監測、清潔生產審核、環境工程保護等技能，能在科研機構、高等學校、企事業單位及行政部門從事科研、教學、環境保護和環境管理等工作的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后適合在環境污染治理企業、環境設備生產企業、工程處理設計部門、環境保護部門、科研機構和學校等單位工作。
主要課程：機械制圖、工程力學、環保設備設計、儀器分析、環境化學、環境生物學、環境監測及環境影響評價、環境微生物學、化工工藝設計、環境科學導論、環境系統工程與優化、環境化學、環境質量評價、環境噪聲控制、固體廢物處理、大氣污染控制、水污染控制、環境工程導論、環境質量評價。本專業培養具備寬厚的生物教育、生物制藥基礎知識、基本理論和基本技能以及一定的制藥工程技術與藥物檢驗等方面知識。具有較強的藥品檢驗與合成，藥品生產現場指導等方面能力。具備進一步攻讀碩士研究生的良好潛質。能在科研機構、制藥企業、環保、商檢等部門從事科學研究、技術開發、生產指導及教育培訓等方面工作的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
生物科學本科專業
（理學學士）
培養目標：本專業培養具備寬厚的生物教育、生物制藥基礎知識、基本理論和基本技能以及一定的制藥工程技術與藥物檢驗等方面知識。具有較強的藥品檢驗與合成，藥品生產現場指導等方面能力。具備進一步攻讀碩士研究生的良好潛質。能在科研機構、制藥企業、環保、商檢等部門從事科學研究、技術開發、生產指導及教育培訓等方面工作的應用型高職業技能素質的高級專門人才。
就業方向：學生畢業后適合在學生畢業后適合于從事生物制藥、化工制藥、生化質檢、環保、生物教育、學校及科研院所等單位工作。
主要課程：植物學、動物學、細胞生物學、教育學、教育心理學、藥劑學、生物化學與分子生物學、天然產物分離技術、發酵工程、生物制藥、保護生物學、環境污染控制工程、解剖生理學、生物藥物分析、生物制藥工藝學、應用微生物學、藥事管理與法規。
畜牧獸醫專科專業
（農林類，成績優秀者畢業時經過考核可升入動物科學、動物醫學本科專業）
培養目標：本專業培養具備畜牧獸醫基本理論知識和動物生產與疫病防治技能，能在畜牧業及其相關部門從事動物保健與檢疫、飼養管理、飼料生產與質量檢驗、疾病診療、經營與管理工作的應用型高職業技能素質的專門人才。
就業方向：學生畢業后，適合在畜牧食品局、養殖企業、飼料動物藥品生產企業、動物檢疫等部門工作。
主要課程：動物解剖學、動物生理學、動物生物化學、動物微生物及免疫學、動物營養與飼料學、家畜病理學、獸醫藥理學、獸醫臨床診斷學、動物遺傳育種學、動物繁殖學、動物性食品衛生檢驗學、畜牧生產學、畜禽普通病學、畜禽流行病學、特種經濟動物養殖學、中獸醫學等。
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