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細菌性痢疾的病原菌為痢疾桿菌，志賀菌屬，對外界抵抗力較強，耐寒、耐濕，但不耐熱和陽光，常用的各種消毒劑均可將其滅活。病人和帶菌者是主要傳染源，主要通過消化道傳播。
多見于平素體格健壯、營養狀況好的小兒。發病季節以夏秋多見。中毒性痢疾的發病機制尚不十分清楚，可能和機體對細菌毒素產生異常強烈的過敏反應（全身炎性反應綜合征）有關。中毒性痢疾腸道病變輕微，但全身病變重。病變在腦組織中最為顯著，可發生腦水腫甚至腦疝，出現昏迷、抽搐和呼吸衰竭，是死亡的主要原因。
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