初步鑒定：挑選可疑菌落3～4個先用志賀菌屬多價診斷血清作試探性玻片凝集試驗。將試探性凝集試驗陽性的菌落至少接種2～3支KIA和MIU，經35 ℃培養18～24h，凡符合KIA：K/A、產氣-/+、H2S-，MIU：動力-、吲哚+/-、尿酶-，并結合試探性玻片凝集試驗陽性結果可鑒定為志賀菌屬。
與類志賀鄰單胞菌和傷寒沙門菌的鑒別：可用動力和氧化酶試驗加以鑒別，志賀菌均為陰性，而類志賀鄰單胞菌為陽性。傷寒沙門菌硫化氫和動力陽性，能與沙門菌屬因子血清（0多價A-F群或Vi）凝集而不與志賀菌屬因子血清凝集。
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