髓質海綿腎本病出生時就存在，但無癥狀，尿液檢查及腎功能正常。其臨床表現主要由并發癥引起，如腎結石和腎感染。因此，常因急性絞痛、血尿、尿路刺激癥狀、膿尿等，進一步檢查時發現本病。囊性病變廣泛者可出現尿濃縮功能和酸化功能減退，尿鈣排泄增加，預后良好，罕有發生腎衰竭。
以往多數病人憑IVP診斷，因為半數病人存在腎結石，在腹部X線平片發現一簇呈放射狀排列在乳頭區的結石。造影劑進入乳頭部的囊腔，形成玫瑰花樣，腎盞常變大而寬。腎外形正常或略增大。
幼年性腎癆髓質囊性病本病多數在兒童或青年期起病，臨床上以尿濃縮功能減退在腎衰竭之前出現，煩渴、多飲、多尿及遺尿為特征性早期表現。尿液除低滲之外可無異常，生長發育滯緩，伴有貧血。腎保鈉功能差，常發生低鈉血癥及血容量不足，尿鈣排泄增加，導致低血鈣及手足抽搐，可繼發甲狀旁腺功能亢進及腎性骨營養不良。發病后5～10年逐漸發展到腎衰竭。
此型是兒童和青年的終末期腎病的常見原因，可能是一組聯合病，除腎病變外，病人或家系成員有色素性視網膜炎、白內障、黃斑變性、近視或眼球震顫等；成人起病髓質囊性病，為常染色體顯性遺傳。四型腎臟病理改變類似，以腎小管萎縮、間質纖維化、腎小球硬化及腎間質小囊腫為特征。
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