老鼠纖維母細胞中的細胞核可見染成藍色的DNA.其中2號染色體及9號染色體，分別以熒光原位雜交方式染成紅色與綠色。細胞核中含有細胞內大多數的遺傳物質，這些遺傳物質由線性DNA組成，且組織成一種稱為染色體的結構。而染色體在細胞周期中大部分的時間里，是以DNA與蛋白質復合而成的染色質形式存在。只有在細胞分裂期間，才會形成染色體組型輪廓清晰的樣貌。除了細胞核外，還有少數的基因存放于粒線體等其他胞器內。
染色質可分為兩種，一種是DNA以較松散的方式組成的真染色質，其中含有細胞中較多可表現的基因。另一種則是DNA結構較為緊密的異染色質，其中的DNA鮮少被轉錄。異染色質又可分為兩種，一種稱為“選擇性”異染色質，含有的基因在特定種類細胞或特定發育階段才會表現;另一種稱為“永久性”異染色質，內含一些染色體構成物，例如端粒或著絲粒。染色質在分裂間期會分別組織在各自的領域中，這些領域稱為“染色體區域”。主要存在于真染色質內的可作用基因，傾向于靠近在染色質區域的邊緣地帶。
可與特定染色質結構，尤其是與核小體結合的一些抗體，與一些自體免疫疾病，如系統性紅斑狼瘡有關。這些抗體稱為抗核抗體(ANA)，已知與一部分發生于多發性硬化癥中的全身性免疫系統失調有關。在早衰癥中，抗體在導致自體免疫疾病癥狀上的影響并不顯著。
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