江門市環境保護局為江門市人民政府工作部門。主要職能如下：
（一）貫徹執行國家和省有關環境保護的方針政策和法律法規，監督實施環境保護標準，組織編制環境功能區劃，擬訂全市環境保護規劃，組織擬訂并監督實施重點區域、流域污染防治規劃和飲用水水源地環境保護規劃，會同有關部門擬訂近岸海域污染防治規劃。
（二）負責全市重大環境問題的統籌協調和監督管理。牽頭協調全市重大環境污染事故、生態破壞事件的調查處理和重點區域、流域、海域環境污染防治工作，指導協調全市重大突發環境事件的應急、預警工作，協調解決跨區域環境污染糾紛，指導、協調和監督海洋環境保護工作。
（三）承擔落實全市污染減排目標的責任。組織制定主要污染物排放總量控制制度并監督實施，提出實施總量控制的指標，督查、督辦、核查各地污染物減排任務的完成情況，牽頭實施環境保護目標責任制、總量減排考核并公布考核結果。
（四）指導并監督管理排污費的征收和使用，會同有關部門管理市級環境保護專項資金。
（五）承擔從源頭上預防、控制環境污染和環境破壞的責任。受市人民政府委托對重大經濟和技術政策、發展規劃以及重大經濟開發計劃進行環境影響評價，按管理權限審批開發建設區域、項目環境影響評價文件，負責建設項目竣工環境保護驗收。
（六）負責環境污染防治的監督管理。制定水體、大氣、 土壤、噪聲、光、惡臭、固體廢物、化學品、機動車等的污染防治管理制度并組織實施，會同有關部門監督管理飲用水水源地環境保護工作，組織指導城鎮和農村的環境綜合整治工作，牽頭組織強制性清潔生產審核工作，負責環境監察和環境保護行政稽查，組織實施排污申報登記、排污許可證、重點污染源環境保護信用管理等各項環境管理制度。
（七）指導、協調、監督生態保護工作。擬訂生態保護規劃，組織評估生態環境質量狀況，監督對生態環境有影響的自然資源開發利用活動、重要生態環境建設和生態破壞恢復工作，指導、協調、監督各種類型的自然保護區、風景名勝區、森林公園的環境保護工作，協調和監督野生動植物保護、濕地環境保護工作，負責全市自然保護區的綜合管理，指導、協調全市農村生態環境保護和生態示范區建設，監督生物技術環境安全，牽頭組織生物物種（含遺傳資源）資源保護工作，組織協調生物多樣性保護。
（八）負責民用核與輻射環境安全的監督管理。協助省監督管理核設施安全，參與民用核事故應急處理，負責輻射環境事故應急處理，監督管理民用核設施、核技術應用、電磁輻射、伴有放射性礦產資源開發利用中的污染防治，參與反生化、反核與輻射恐怖襲。
（九）負責環境監測和發布環境狀況公報、重大環境信息。組織對全市環境質量監測和污染源監督性監測，組織對環境質量狀況進行調查評估、預測預警，組織建設和管理本市環境監測網和環境信息網。
（十）開展環境保護科技工作。組織環境保護重大科學研究和技術工程示范，參與指導和推動環境保護產業發展。
（十一）組織、指導和協調環境保護宣傳教育工作。組織實施環境保護宣傳教育綱要，開展生態文明建設和環境友好型社會建設的有關宣傳教育工作，推動社會公眾和社會組織參與環境保護。
（十二）協調本市有關環境保護對外合作項目。
（十三）承辦市人民政府和省環境保護廳交辦的其他事項。
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