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皖南醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的前身是基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部（簡稱基礎(chǔ)部），始建于1986年，2013年4月更名為基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。

目前，學(xué)院擁有12個教研室（人體解剖學(xué)、組織學(xué)與胚胎學(xué)、生理學(xué)、生物化學(xué)、病理解剖學(xué)、病理生理學(xué)、微生物學(xué)與免疫學(xué)、寄生蟲學(xué)、藥理學(xué)、醫(yī)學(xué)生物學(xué)、醫(yī)用物理學(xué)、醫(yī)用基礎(chǔ)化學(xué)）、2個實驗教學(xué)中心（機能學(xué)實驗中心、形態(tài)學(xué)實驗中心）、6個科學(xué)研究機構(gòu)（定量藥理研究所、蛇毒蛇傷研究所、醫(yī)學(xué)遺傳研究室、發(fā)育生物學(xué)研究室、醫(yī)學(xué)蜱螨研究所、優(yōu)生優(yōu)育研究室）、1個一級學(xué)科碩士學(xué)位授予點（基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)）、7個二級學(xué)科碩士學(xué)位授予點（藥理學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、病原生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合基礎(chǔ)、免疫學(xué)、人體解剖與組織胚胎學(xué)）、7個省精品課程（病理生理學(xué)、醫(yī)學(xué)免疫學(xué)、醫(yī)學(xué)微生物學(xué)、藥理學(xué)、人體解剖學(xué)、人體寄生蟲學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)）、1個省級重點學(xué)科（病原生物學(xué)）、4個校級重點學(xué)科（病原生物學(xué)、病理生理學(xué)、醫(yī)學(xué)免疫學(xué)、藥理學(xué)）、1個國家中醫(yī)藥管理局三級實驗室（中藥藥理實驗室）、2個省級實驗教學(xué)示范中心（機能實驗中心、病原生物學(xué)實驗中心）、3個省級教學(xué)團隊（藥學(xué)教學(xué)團隊、人體寄生蟲學(xué)團隊、醫(yī)學(xué)免疫學(xué)教學(xué)團隊）。

學(xué)院現(xiàn)有教職工147人，其中專任教師116人；教授、副教授57人、講師45人；全國優(yōu)秀教師2人、省教學(xué)名師1人、省模范教師2人、省級教壇新秀5人；具有博士31人，碩士80人，碩士以上學(xué)歷者占教師總數(shù)75.51%。承擔(dān)著全校各專業(yè)層次包括碩士研究生、本專科生理論和實踐教學(xué)任務(wù)。

近30年來，學(xué)院在校黨政領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)心和支持下，一直堅持以教學(xué)質(zhì)量為核心，嚴謹治學(xué)，為培養(yǎng)社會需要的高層次醫(yī)學(xué)人才作出了積極的貢獻。

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