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氣相色譜檢測器可分為濃度型檢測器和質量型檢測器兩大類。濃度型檢測器的響應值與載氣中組分濃度成正比，例如熱導檢測器、電子捕獲檢測器等。質量型檢測器的響應值與單位時間內進入檢測器的組分質量成正比，例如火焰離子化檢測器、火焰光度檢測器等。
1．火焰離子化檢測器火焰離子化檢測器(FID)是利用有機物在氫火焰的作用下，化學電離而形成離子流，通過測定離子流強度進行檢測。FID對碳氫化合物響應良好，適合檢測大多數的藥物。除另有規定外，藥物氣相色譜分析一般用FID，用氫氣作為燃氣，空氣作為助燃氣；檢測器溫度一般應高于柱溫，并不得低于150℃，以免水汽凝結，通常為250～350℃。
2．電子捕獲檢測器電子捕獲檢測器(ECD)是利用電負性物質俘獲電子的能力，通過測定電子流進行檢測。ECD適用于含鹵素、硫、氧、羰基、氰基等強電負性基團化合物的檢測，主要用于含鹵素藥物的測定。目前已廣泛應用于有機氯和有機磷農藥殘留量、金屬配合物、金屬有機多鹵或多硫化合物等的分析測定。
3．質譜檢測器質譜檢測器(MS)具有高靈敏度、高專屬性的特點，不僅可用于多數藥物的檢測，還能給出供試品某個成分相應的結構信息，可用于結構確證。
4．熱導檢測器熱導檢測器(TCD)是利用組分與載氣的熱導率差異來檢測組分的濃度變化。TCD具有構造簡單、測定范圍廣、樣品不被破壞等優點，但靈敏度低，實際應用較少。
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