根莖類是一類變態莖，為地下莖的總稱，包括根狀莖、塊莖、球莖及鱗莖等。根莖表面有節和節間，單子葉植物尤為明顯；節上常有退化的鱗片狀或膜質狀小葉、葉柄基部殘余物或葉痕；有時可見幼芽或芽痕；根莖上面或頂端常殘存莖基或莖痕，側面和下面有細長的不定根或根痕。藥材中以根狀莖多見，其形狀不一，有圓柱形、紡錘形、扁球形或不規則團塊狀等。鱗莖的地下莖呈扁平皿狀，節間極短，稱鱗莖盤，上面有肉質肥厚的鱗葉，如百合、川貝母等。塊莖常呈不規則塊狀或類球形，如天麻、半夏等。蕨類植物的根莖表面常有鱗片或鱗毛，有的根莖上密布葉柄殘基。
觀察根莖的橫斷面，首先應注意區分雙子葉植物根莖和單子葉植物根莖。一般說來，雙子葉植物根莖外表常有木栓層；橫切面有放射狀結構，木部尤為明顯；中央有明顯的髓部；形成層環明顯。單子葉植物根莖外表無木栓層或僅具較薄的栓化組織；橫切面不呈放射狀結構，皮層及中柱均有維管束小點散布；無髓部；通常可見內皮層環紋。其次，應注意根莖斷面組織中有無分泌組織散布，如川芎、白術的油點等。還應注意少數雙子葉植物根莖的異常構造，如大黃的星點等。
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