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園藝學院是金陵科技學院最早建立的二級學院之一，設有園藝、園林、設施農業科學與工程3個本科專業，其中園藝專業、園林專業為學校特色專業；園藝學為南京市重點學科，園林植物與觀賞園藝、風景園林為學校重點建設學科。學院還與美國紐約州立大學科貝爾斯基爾農業與技術學院合作進行（3+1）園藝（生物技術）專業聯合培養，學生畢業后可獲得中外兩校的文憑。學院現有全日制在校生1262人。

園藝學院設有園藝系、園林系、設施農業科學與工程系和園藝實驗教學中心等4個教學單位，園藝實驗教學中心建有土壤肥料學、微生物學、植物學、植物組織培養學、蔬菜學、園林植物與觀賞園藝學、植物保護學、計算機輔助園林設計室、園林制圖室、園林工程室等27個實驗室，教學儀器設備總值達1300萬元。擁有校內實驗實訓基地1個、南京市工程中心1個、江蘇省果樹品種改良與種苗繁育工程中心——果樹遺傳學與組學分析分中心；設有金陵科技學院國家職業技能鑒定所——園藝學院職業技能鑒定站，能夠承擔種植專業初、中、高三個等級的職業技能鑒定；設有金陵科技學院傅家邊綠豐茶葉研究所和南京金陵科技園林規劃設計(院)有限公司兩個產學研合作機構。

園藝學院現有教職工48人，專任教師45人，其中教授9人，副教授21人，高級職稱32人，占70%；具有博士學位教師20人，占42%；歷年來，園藝學院教師積極開展教研、科研活動，多項科研成果通過農業部及省、市的鑒定并受到嘉獎。

學院秉承“厚德興業”的校訓和“三干三創”的校風，堅持“需求導向，能力為本，知行合一，重在創新”的人才培養理念，切實培養適應地方經濟社會發展需要的專業基礎扎實、職業素養好、實踐能力強、發展后勁足的高級應用型人才，多年來，共為社會培養了園藝園林等專業人才6000余人，深受社會及用人單位的歡迎和好評。