茶與食品科技學院設有茶業系、食品工程系。下設茶學、茶文化與貿易、食品科學與工程、食品質量與安全和食品衛生與營養學等5個本科專業；擁有園藝學博士后流動站1個，茶學二級學科博士授權點1個、食品科學與工程一級學科碩士授權點1個，茶學、食品科學、農產品加工與貯藏、營養與食品衛生學和糧油、油脂及植物蛋白工程、食品加工與安全（專碩）二級學科碩士授權點6個。
茶學為國家重點培育學科、農業部和安徽省重點學科，茶學專業為國家級特色專業，是安徽省首批設立特聘教授崗位的學科，建有中華茶文化研究所。所屬茶葉生物化學與生物技術實驗室為國家重點實驗室培育基地及教育部和安徽省重點實驗室，同時為農業部茶樹生物學與茶葉加工重點實驗室。
食品學科的食品科學與工程專業為安徽省特色專業。建有安徽省農產品加工工程實驗室，合肥市農產品加工研究院。與安徽省出入境檢驗檢疫局共建食品安全分析與檢測省級重點實驗室。
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