農學院本科辦學始于1978年，現有農藝教育、農學、種子科學與工程、植物保護4個本科專業，其中農藝教育為省級教改示范專業、種子科學與工程專業為省級特色專業和國家級綜合改革試點專業。專任教師36人，其中教授9人，副教授10人，碩士生導師10人，博士11人，在讀博士5人，全國優秀教師2人，省中青年拔尖人才1人，省級學科帶頭人3人，省骨干教師1人，省優秀教師2人，省教學名師1人，省輔導員年度人物1人，享受政府特殊津貼教師1人。
學院現有安徽省作物遺傳育種重點學科、作物遺傳育種省級教學團隊、安徽省飼草育種115創新團隊、蚌埠市甜葉菊品種選育3221創新團隊、《作物遺傳育種原理》和《種子生產技術》省級精品課程。獲批省級“農學類應用型創新創業人才培養模式創新實驗區”立項建設單位。擁有玉米育種安徽省工程技術研究中心、安徽省甜葉菊育種與栽培工程技術研究中心，設有作物學實驗室、種子科學與工程實驗室、遺傳學實驗室和植物保護實驗室，配備現代化種子加工檢測及植物分子育種儀器設備，建有日光溫室、網室和40畝校內試驗實踐教學科研基地。
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